La historia de la banda del Real Colegio San Francisco de Asís lleva una trayectoria de 35 años, por la cual han pasado distinguidos profesores como el profesor Miguel Ángel, quien fue el que le empezó a formar y dirigir en el formato Banda de Guerra, la cual años más tarde cambió al formato de Banda de Paz, adquiriendo así una uniformidad con los colores de la bandera del colegio, que en aquella época eran el blanco y el rojo; de esta manera, la banda empezó a prestar servicios sociales en los diferentes eventos religiosos en la localidad de Popayán, ya que nuestra institución, en aquellos años, se encontraba situada en el centro de la ciudad. En el año 2007, toma posesión de la banda el profesor Geovavanny Salazar dándole una transformación total, convirtiéndola de Banda de Paz a Banda Rítmica, dónde se empiezan a implementar instrumentos latinos, dándole una sonoridad más alegre y mucho más orquestada en los diferentes ritmos latinos y populares, brindándole al colegio grandes méritos en las diferentes modalidades, siendo partícipe en encuentros nacionales y departamentales.

En el año 2015, llega el profesor Diego Mosquera, quien toma dirección y posesión de la banda, trayendo consigo una nueva esencia para la banda transformándola en Banda Latina , rescatando así nuestros ritmos Colombianos como son la cumbia, el porro, la raspa, el Bambuco, entre otros ritmos propios de la región. La banda también se ha caracterizado por interpretar ritmos latinos como lo son la salsa, el Wawancó, merengue, entre otros; es de resaltar que, en todos estos años, la banda ha sido reconocida como una de las mejores bandas sonoras tanto en la parte disciplinaria como en la parte musical dejando hasta el momento nuestra institución educativa muy en alto. En este tiempo, los méritos de la banda han enaltecido a la institución, tanto en la ciudad como en los diferentes municipios del departamento del Cauca, siendo ejemplo de compromiso y sentido de pertenencia.